Государственное бюджетное учреждение здравоохранения «Научно-практический центр специализированной медицинской помощи детям имени В.Ф.Войно-Ясенецкого Департамента здравоохранения города Москвы» было основано в соответствии с приказом Департамента здравоохранения города Москвы от 17 марта 1995 года №75. НПЦ первоначально работал в приспособленном здании по адресу Можайское шоссе, дом 6. 

С 1 сентября 2004 года наш Центр занимает специально построенные современные корпуса по адресу ул. Авиаторов, дом 38 в районе Солнцево.

Со дня основания директор НПЦ - доктор медицинских наук, профессор, Заслуженный врач РФ Андрей Георгиевич Притыко.

В стационар НПЦ, рассчитанный на 270 коек, госпитализируются дети от первых часов жизни до 18 лет по следующим направлениям:

- нейрохирургия (гидроцефалия, внутримозговые кровоизлияния, спинномозговая грыжа, хирургия эпилепсии, хирургия ДЦП, в том числе ботулинотерапия и терапия баклофеном.

- офтальмология(ретинопатия недоношенных детей, косоглазие и др.);

- онкология (химиотерапия и хирургия новообразований различной локализации и онкоортопедия;

- нейроонкология;

- неонатология (в т. ч. выхаживание новорождённых и недоношенных детей, детей с экстремально низкой массой тела);

- неврология (фармакорезистентные формы эпилепсии, ДЦП и др.);

- черепно-челюстно-лицевая хирургия;

- санация полости рта под наркозом детям-инвалидам, ортодонтическая помощь;

- оториноларингология;
ортопедия (коррекция тяжёлых деформаций позвоночника, хирургия последствий спастики у детей);

- респираторная поддержка и респираторная реабилитация пациентов с хронической зависимостью от аппарата ИВЛ;

- физиотерапия и ЛФК при ДЦП, после травм, хирургических операций, при патологии ЛОР-органов и др.;

- урология и плановая хирургия, в т. ч. лапароскопические операции.

Врачи НПЦ освоили новейшие технологии лечения пациентов: плазменную хирургию, методики термоабляции, водоструйную хирургию, лапароскопические методики; повседневной практикой стали органосохраняющие операции. В нашем Центре проводится международное клиническое исследование по лечению ретинопатии недоношенных.

Диагностика в НПЦ проводится на самом современном оборудовании, в т. ч. РКТ, МРТ 3,0 Тл, УЗИ-аппаратах экспертного класса. Отделение физиотерапии и лечебной физкультуры располагает богатым оснащением, в т. ч. бассейном, что позволяет эффективно проводить реабилитацию маленьких пациентов.

Лечение в Центре проводится в рамках ОМС, госзадания (в т. ч. ВМП) и платных медицинских услуг.

Ежегодно в НПЦ получают лечение более 10 тысяч детей из Москвы, регионов России, стран ближнего и дальнего зарубежья. Хирурги Центра выполняют около 5000 операций, из них более 30% эндоскопических.

НПЦ является базой кафедр РНИМУ им. Н.И.Пирогова. В 2015 году на базе Центра создана Университетская клиника в составе 10 кафедр.